Судебный департамент возглавляет Генеральный директор Судебного департамента, который назначается на должность и освобождается от должности

Президентом РФ

Председателем Квалификационной коллегии судей

Председателем Верховного Суда РФ с согласия Совета судей РФ

Советом Федерации РФ с представления Президента РФ